A elaboração do PROTRAM desenvolve-se em 5 fases, ao longo de 15 meses, de acordo com o cronograma seguinte:
| Fases | | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | |
| __ Mês | ||||||||||||||||
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| 1. Diagnóstico e opções estratégicas |  |
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| 2. Pré-proposta de PROTRAM |
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| 3. Proposta de PROTRAM |
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| 4. Discussão Pública |
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| 5. Versão final de PROTRAM |  |
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